Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA3Q9Y5J5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHLDA3Q9Y5J5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms