Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP15Q9Y4E8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP15Q9Y4E8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP15Q9Y4E8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP15Q9Y4E8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms