Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
NRXN3Q9Y4C0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NRXN3Q9Y4C0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NRXN3Q9Y4C0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NRXN3Q9Y4C0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NRXN3Q9Y4C0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NRXN3Q9Y4C0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
NRXN3Q9Y4C0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NRXN3Q9Y4C0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms