Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR2E1Q9Y466 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NR2E1Q9Y466 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR2E1Q9Y466 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR2E1Q9Y466 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms