Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX24Q9Y343 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX24Q9Y343 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX24Q9Y343 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX24Q9Y343 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms