Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
YBX2Q9Y2T7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YBX2Q9Y2T7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YBX2Q9Y2T7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
YBX2Q9Y2T7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YBX2Q9Y2T7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms