Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP8A1Q9Y2Q0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms