Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P5

SLC27A5, Bile acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A5Q9Y2P5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A5Q9Y2P5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A5Q9Y2P5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A5Q9Y2P5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC27A5Q9Y2P5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A5Q9Y2P5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms