Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAN1Q9Y2M0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAN1Q9Y2M0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FAN1Q9Y2M0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAN1Q9Y2M0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms