Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PoleQ9WVF7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PoleQ9WVF7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PoleQ9WVF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PoleQ9WVF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PoleQ9WVF7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PoleQ9WVF7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PoleQ9WVF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PoleQ9WVF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PoleQ9WVF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PoleQ9WVF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PoleQ9WVF7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PoleQ9WVF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms