Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1a4Q9WV27 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp1a4Q9WV27 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1a4Q9WV27 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1a4Q9WV27 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms