Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabbr1Q9WV18 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gabbr1Q9WV18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gabbr1Q9WV18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gabbr1Q9WV18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabbr1Q9WV18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms