Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnfsf13bQ9WU72 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnfsf13bQ9WU72 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnfsf13bQ9WU72 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnfsf13bQ9WU72 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfsf13bQ9WU72 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfsf13bQ9WU72 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms