Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Lemd3Q9WU40 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lemd3Q9WU40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lemd3Q9WU40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lemd3Q9WU40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lemd3Q9WU40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Lemd3Q9WU40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Lemd3Q9WU40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Lemd3Q9WU40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Lemd3Q9WU40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Lemd3Q9WU40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Lemd3Q9WU40 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Lemd3Q9WU40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lemd3Q9WU40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms