Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkraQ9WTX2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrkraQ9WTX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkraQ9WTX2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkraQ9WTX2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkraQ9WTX2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkraQ9WTX2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms