Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vax2Q9WTP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax2Q9WTP9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax2Q9WTP9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms