Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
THSD7AQ9UPZ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
THSD7AQ9UPZ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
THSD7AQ9UPZ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
THSD7AQ9UPZ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
THSD7AQ9UPZ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
THSD7AQ9UPZ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
THSD7AQ9UPZ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
THSD7AQ9UPZ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
THSD7AQ9UPZ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
THSD7AQ9UPZ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
THSD7AQ9UPZ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms