Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HPS5Q9UPZ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HPS5Q9UPZ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HPS5Q9UPZ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HPS5Q9UPZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms