Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SATB2Q9UPW6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SATB2Q9UPW6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB2Q9UPW6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SATB2Q9UPW6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms