Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC12A4Q9UP95 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A4Q9UP95 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A4Q9UP95 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms