Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNP9

PPIE, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIEQ9UNP9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPIEQ9UNP9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPIEQ9UNP9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPIEQ9UNP9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPIEQ9UNP9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms