Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF490Q9ULM2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF490Q9ULM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF490Q9ULM2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms