Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH9Q9ULB4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDH9Q9ULB4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH9Q9ULB4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH9Q9ULB4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH9Q9ULB4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms