Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME2Q9UL46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME2Q9UL46 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME2Q9UL46 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME2Q9UL46 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME2Q9UL46 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME2Q9UL46 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME2Q9UL46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME2Q9UL46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME2Q9UL46 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME2Q9UL46 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms