Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC2LQ9UL33 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms