Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MYH13Q9UKX3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
MYH13Q9UKX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYH13Q9UKX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MYH13Q9UKX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MYH13Q9UKX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms