Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDAC9Q9UKV0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
HDAC9Q9UKV0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HDAC9Q9UKV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
HDAC9Q9UKV0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms