Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RCOR1Q9UKL0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RCOR1Q9UKL0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RCOR1Q9UKL0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCOR1Q9UKL0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCOR1Q9UKL0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms