Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PARP4Q9UKK3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PARP4Q9UKK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PARP4Q9UKK3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PARP4Q9UKK3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PARP4Q9UKK3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PARP4Q9UKK3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.3 ms