Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO9Q9UK97 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO9Q9UK97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO9Q9UK97 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO9Q9UK97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms