Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF223Q9UK11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF223Q9UK11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF223Q9UK11 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms