Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C3orf18Q9UK00 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C3orf18Q9UK00 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C3orf18Q9UK00 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C3orf18Q9UK00 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms