Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms