Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTNNA3Q9UI47 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CTNNA3Q9UI47 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CTNNA3Q9UI47 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms