Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC3Q9UHC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC3Q9UHC3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC3Q9UHC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC3Q9UHC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC3Q9UHC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms