Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SS18L2Q9UHA2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SS18L2Q9UHA2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms