Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA9Q9UGM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHRNA9Q9UGM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms