Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGGBP1Q9UFW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGGBP1Q9UFW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGGBP1Q9UFW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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