Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTI1BQ9UEU0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTI1BQ9UEU0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTI1BQ9UEU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1BQ9UEU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms