Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms