Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-2Q9UD57 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKX1-2Q9UD57 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX1-2Q9UD57 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX1-2Q9UD57 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms