Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEMTQ9UBM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEMTQ9UBM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PEMTQ9UBM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms