Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAGEC2Q9UBF1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAGEC2Q9UBF1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAGEC2Q9UBF1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAGEC2Q9UBF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms