Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD2Q9UBB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD2Q9UBB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD2Q9UBB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD2Q9UBB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD2Q9UBB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms