Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek3Q9R0A5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek3Q9R0A5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek3Q9R0A5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek3Q9R0A5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek3Q9R0A5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nek3Q9R0A5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms