Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf4Q9QZS2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf4Q9QZS2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms