Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a3Q9QZS0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a3Q9QZS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a3Q9QZS0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col4a3Q9QZS0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a3Q9QZS0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms