Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmlQ9QZD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmlQ9QZD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChmlQ9QZD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmlQ9QZD5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ChmlQ9QZD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms