Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpc3Q9QZC1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc3Q9QZC1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc3Q9QZC1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc3Q9QZC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc3Q9QZC1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc3Q9QZC1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms