Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ39

St6galnac1, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac1Q9QZ39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
St6galnac1Q9QZ39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
St6galnac1Q9QZ39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
St6galnac1Q9QZ39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
St6galnac1Q9QZ39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
St6galnac1Q9QZ39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms